ミッションモードは、本編を一度クリアすると出現するモード。Lv. 1 ～ 10 まであり、各レベルに 1 ～ 3 つ、計 20 ステージが用意されている。

　クリア成績によってランクが変わり、全ミッションを最高ランクの「S」でクリアするとトロフィー／実績「無」が獲得できる。また、「エクストラメニュー」にて装備機能「無」が交換可能になる。

無 すべてのミッションを最高評価でクリアした

60 G

　ステージクリア時の成績に応じて、赤と青の霊力の欠片が報酬として得られる。これは何度でも入手できるため、本編では供給量が渋かった霊力の欠片も、 容易にカンスト（最大は 999）まで稼げる。各ステージのクリア状況やハイスコアもそうだが、霊力の欠片を稼いだ後は、セットアップ画面で必ずセーブしておくこと。

　なお、ミッション開始時の蓄積霊子は本編のセーブデータの状態を引き継いでいるため、本編で蓄積霊子を MAX にした状態でセーブしておき、そのセーブデータでミッションモードに挑むと、ミッション中に霊子を溜めなくて済む。

　装備機能「祭」の有無で難度が激変するため、トロフィー／実績制覇のために全ミッションの S ランクをサクッと取りたい人は、まず「祭」を先に取得することをオススメする。以下の攻略も、「祭」の使用を前提としている。ただし、長四郎は「祭」の恩恵を受けられないため、流歌・海咲のステージよりは若干だが苦戦すると思われる。

　装備機能「祭」は常時フェイタルフレームになるという強力なものだが、それに加え、フィルムを消費しないという効果もある。装備機能「無」による「フィルムが減らない効果」はミッションモードでは無効になるのだが、「祭」のほうは有効。

　ただし、ミッションモードでは「無」と「祭」を同時に装備しているとフィルムを消費してしまうので注意。ミッションモード中は「無」をオフにするか、「祭」入手後はそもそも「無」をずっとオフでいい。

　フィルムが減らない機能を持つ「無」がミッションモードでのみ効果を発揮しないようにされていることを考えると、「祭」によるフィルムが減らない効果は不具合なのではないかと思われる人もいるかもしれない。

　だが、実は 不具合によって「祭」を取得できなかった Wii 版でも内部的に「祭」は存在していて、Wii 版の時点で「祭」にフィルムが減らない効果はあった。今回、リマスターという機会があったにもかかわらず性能が変化していないところを見ると、これが仕様だと考えてよさそうだ。

「祭」の取得は攻略情報なしでは難しく、装備機能「無」より上位の存在として位置付けられていると思われる。本作をやり込んだ者へのご褒美であり、その名の通り、お祭り的な何でもアリのオマケ機能。ミッションモードを真剣に楽しみたい人は、あえて使用せずに挑戦してみるといいだろう。

　開始したらフィルムを一四式に変え、円香をロックオンしてフェイタルフレーム→フェイタルフレーム→強化レンズ「撃」でトドメ。最初の一撃はできるだけ引き付け、撮影後のノックバックで円香が障害物にめり込まないようにすると上手くいきやすい。

　強化レンズは常時「絆」でチェインを狙う。開始直後にすぐ構えて溜め始め、足元に出現する曲木に向けて Max Shot（最大溜め）＋ Close Shot（至近距離）。以後は常に Max Shot ＋ Close Shot になるよう、常時溜めながら、曲木が出現したら接近して攻撃していく。5 回で倒せるはず。

　開始したら、まずフィルムを六一式にチェンジ。棺に近付くと “わたし” が出現するので、フェイタル 2 回からの「撃」で倒した後、少し左を見ると千堂 翳がいるので、もう一度フェイタル 2 回からの「撃」で終わり。“わたし” は撮影後のノックバックがないため、近付きすぎるとフェイタルフレームコンボ中に掴まれることもあるので注意。

　このミッションはよく分からない部分があり、“わたし” を倒しても、少し経つと復活したり、“わたし” がいる内は千堂 翳をいくら攻撃しても倒れないような……？　とにかく “わたし” →千堂 翳の順で倒し、“わたし” が復活していたら、そちらを優先的に狙って……の繰り返しでいけるはず。

　開始したらフィルムを一四式に変え、フェイタル 2 回からの「滅」で終わり。

　霊子が溜まっていない場合は、まず〇七式フィルムで攻撃を 3 回→ 3 回で計 6 発当てて霊子を溜め、次に片桐 省二が出現したときに一四式フィルムで攻撃→「滅」でシメ。